海航对于飞行员的日常训练要求十分严格，在模拟机飞行训练中全程监控飞行员的每一个动作，并对机长进行严格的资质排查，对于技术上、作风上不符合机长要求的，一律取消资格。每位新飞行员在航空学校均需接受高标准的技术训练，确保根基实力符合要求。
随着海航国际化进程的深入及国家对反恐的日益重视，海航打造了一支千人的专业空中安保力量，借鉴西方先进的安保技术和执勤器械，引入国际标杆安保企业的培训方式，提升空中安保应急处置能力。
以海航旗下的天津航空为例。天津航空于2011年启用背景调查，对空勤人员进行严格审查，并制定了完善的《安全保卫培训大纲》，有计划地全员开展安保培训。
天津航空还结合机型特点，突出机组之间的配合，并针对各类非法干扰行为或扰乱行为，制定了反劫机、爆炸物威胁和殴打机组等15项专项处置方案。公司每年开展处置预案评审工作，评估处置程序，在工作中不断完善预案，保持各项应急处置预案的有效性、针对性和可操作性。
2012年6月29日，天津航空GS7554航班机组执行新疆和田到乌鲁木齐飞行任务时，遭遇6名歹徒暴力劫机。危急时刻，机组人员在旅客协助下，与暴徒展开了惊心动魄的殊死搏斗，成功制服歹徒，成功粉碎了犯罪分子劫机图谋，避免了一起机毁人亡的重大事件。
2015年，海航以“零不符合项”通过“国际航协加强型运行安全审核”的组织机构与管理、飞行运行、运行控制和航空安保等8个专业组审核。
黄琪珺说：“100个飞行员，有99个合格，1个不合格，那安全管理也是失败的，功底扎实的飞行队伍是保证飞行安全的基础。保障航行安全既是为了对旅客生命负责，也是为了守护航企的生命线。
