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滥用职权造成军粮供应站重大损失
公诉机关指控，吴清新作为依照法律、法规规定行使国家行政管理职权的组织中从事公务的人员，未认真执行国家粮食储备管理办法等有关政策，违规将储备粮委托给不具备资质的誉新公司进行轮换，又疏于对储备粮轮换及贷款使用进行监管，滥用职权，造成海口市军粮供应管理站储备粮缺库1231吨，折合人民币6155000元，扣除掉誉新公司缴纳给军供站的40万元代储保证金，军供站在储备粮业务上的损失为5929880元无法追回；造成粮食质量达标率为0%；造成海口军粮供应管理站641万元贷款无法归还。
被告否认
吴清新法庭上自称“从没贪污一分钱”
53岁的吴清新站在被告席上，头发花白。“对于受贿罪，我认罪，我悔罪，我愿意接受法律的制裁。”在法庭上，吴清新说，对于公诉机关指控的受贿罪的罪名无异议，但对具体的金额有异议，而对于公诉机关指控的贪污、滥用职权罪名，也有异议。
受贿金额不是129万？
受贿金额不是129万，是多少呢？庭审中，吴清新推翻了自己此前所做的供述，称只收了45万元。同时吴清新还表示，他工作这么多年从来没有贪污一分钱，对于粮库造成的损害，他也只是监管不力，并没有滥用职权。
没有滥用职权侵吞公款？
对于利用职务之便侵吞公款的指控，吴清新说签订虚假的储备粮仓库租金条款，主要是为了设立小金库。因为平时军供站的接待费用较多，很多的费用难以报销，就只好用套取的资金支付。吴清新表示，设立小金库是经过领导班子讨论之后决定这么做的，套取的资金都是军供站在使用，此事领导知道得比较详细，其他的工作人员大概知道。“负责接待的工作人员都可以使用这笔资金，但必须通过我的同意。”吴清新说。
在法庭上，公诉机关详细地列举了吴清新贪污、受贿、滥用职权罪的相关证据。虽然，吴清新在法庭上推翻了之前的供述，但并没有提供相关的证据。公诉人在法庭上指出，吴清新当庭的供述和之前侦查阶段的供述以及审查起诉阶段的供述截然不同，和其他的证人证言相互违背。
